Instituciones con las que CIESAS colabora en la actualidad
- Avina Americas
- British Academy
- Centro de Ingeniería y Desarrollo Industrial (CIDESI)
- Centro de Investigación en Geografía y Geomática, Ing. Jorge L. Tamayo A. C. (CENTROGEO)
- Michelsens Institute
- Comisión Estatal de Conciliación y Arbitraje Médico (CECAMED)
- Comisión Federal de Electricidad (CFE)
- Comisión nacional de Derechos Humanos (CNDH)
- Comisión Nacional para el Desarrollo de los Pueblos Indígenas (CDI)
- Comisión Nacional para Prevenir y Erradicar la Violencia contra las Mujeres (CONAVIM)
- Consejo Nacional de Evaluación de la Política de Desarrollo Social (CONEVAL)
- Coordinación Estatal de Asuntos Internacionales y de Apoyo a Migrantes Poblanos
- FOUNDATION OPEN SOCIETY
- Fundación Kellogg
- Fundación MacArthur
- Fundación Rio Arronte
- Fundación the William and Flora Hewlett
- International Development Research Center / Centre de Recherches pour le Développement International IDCR/CRDI
- Institut de Recherche pour le Developpement
- Instituto de Salud del Estado de Chiapas
- Instituto Estatal de Educación Pública de Oaxaca (IEEPO)
- Instituto Federal de Telecomunicaciones (IFT)
- Instituto Nacional de Lenguas Indígenas (INALI)
- Laboratorio LABEX-EFL
- LATIR, A.C.
- Max Planck Institute, Holanda
- Municipio de Tlajomulco de Zuñiga, Jalisco
- Municipio de Zapopan, Jalisco
- Norwegian University of Live Sciences
- Pfizer, S.A. de C.V.
- Programa de Inclusión Social (PROSPERA)
- Secretaría de Educación Pública del Estado de Puebla
- Secretaría de Planeación, Administración y Finanzas del Poder Ejecutivo del Estado de Jalisco
- Sinergia Integral Empresarial, S.A. de C.V.
- SOAS University of London
- Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación
- UC MEXUS – CONACYT
- Unión Europea Delegación México
- Universidad de California
- Universidad de Cambridge
- Universidad de Luxemburgo
- Universidad de Texas en Austin
- University College London
- University of California, Los Angeles (UCLA)